Il Consiglio delle autonomie locali, ai sensi dell’art. 6, comma 2, della legge regionale 12/2015, ha istituito quattro commissioni, per lo studio e l’approfondimento di singoli e specifici argomenti che riguardano il sistema delle autonomie locali, con le competenze nelle materie sotto specificate. Ogni componente del Consiglio deve far parte almeno di due commissioni. Ciascuna commissione nomina, al proprio interno, un coordinatore tranne la I, il cui coordinatore è il Vicepresidente.

I membri delle commissioni che sono Sindaci nominati dalle conferenze dei Sindaci degli ambiti territoriali possono delegare per iscritto altro Sindaco componente dello stesso ambito territoriale.

I componenti Sindaci dei Comuni di Gorizia, Pordenone, Udine e Trieste possono delegare i componenti delle rispettive giunte.

Alle sedute delle commissioni possono partecipare anche i funzionari competenti dei rispettivi enti locali.
Di ogni seduta delle commissioni viene redatto un verbale in forma riassuntiva che viene sottoscritto dal coordinatore. Il Consiglio può istituire anche gruppi di lavoro. Alle commissioni e ai gruppi di lavoro possono partecipare soggetti esterni, invitati dal coordinatore o dal Presidente del Consiglio.